Hiện nay người ta biết 18 loài và phân loài còn tồn tại thuộc hai chi[2]

• Chi Erpetoichthys
  • Erpetoichthys calabaricus Smith, 1865 (đồng nghĩa: Calamoichthys calabaricus): Cá nhiều vây bụi sậy.
• Chi Polypterus
  • Polypterus ansorgii Boulenger, 1910: Cá nhiều vây Guinea.
  • Polypterus bichir
    • Polypterus bichir bichir Lacépède, 1803: Cá nhiều vây sông Nin.
    • Polypterus bichir katangae Poll, 1941.
    • Polypterus bichir lapradei Steindachner, 1869: Cá nhiều vây.
  • Polypterus delhezi Boulenger, 1899: Cá nhiều vây vạch sọc.
  • Polypterus endlicheri
    • Polypterus endlicheri congicus Boulenger, 1898.
    • Polypterus endlicheri endlicheri Heckel, 1847: Cá nhiều vây yên ngựa.
  • Polypterus mokelembembe Schliewen & Schafer, 2006.[3].
  • Polypterus ornatipinnis Boulenger, 1902: Cá nhiều vây lòe loẹt.
  • Polypterus palmas
    • Polypterus palmas buettikoferi Steindachner, 1891.
    • Polypterus palmas palmas Ayres, 1850: Cá nhiều vây ngắn.
    • Polypterus palmas polli Gosse, 1988.
  • Polypterus retropinnis Vaillant, 1899: Cá nhiều vây Tây Phi.
  • Polypterus senegalus
    • Polypterus senegalus meridionalis Poll, 1941.
    • Polypterus senegalus senegalus Cuvier, 1829: Cá nhiều vây xám.
  • Polypterus teugelsi Britz, 2004.
  • Polypterus weeksii Boulenger, 1898: Cá nhiều vây đốm.

Các loài đã tuyệt chủng bao gồm:

• Polypterus dageti
• Polypterus faraou Otero và ctv., 2006 — cuối thế Miocen.[4]
• Polypterus sudanensis

Các chi đã tuyệt chủng sau đây có thể thuộc về bộ Polypteriformes.

• Dagetella
• Latinopollia
• Serenoichthys
• Bartschichthys
• Sudania
• Saharaichthys
• Sainthilaria
• Inbecetemia
• Nagaia